Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4bP01029 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4bP01029 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4bP01029 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4bP01029 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C4bP01029 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4bP01029 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4bP01029 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4bP01029 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4bP01029 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4bP01029 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4bP01029 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4bP01029 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4bP01029 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4bP01029 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4bP01029 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4bP01029 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4bP01029 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4bP01029 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4bP01029 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4bP01029 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4bP01029 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4bP01029 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4bP01029 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4bP01029 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C4bP01029 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C4bP01029 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C4bP01029 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4bP01029 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4bP01029 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C4bP01029 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4bP01029 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4bP01029 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4bP01029 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4bP01029 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4bP01029 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4bP01029 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C4bP01029 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C4bP01029 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C4bP01029 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C4bP01029 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C4bP01029 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4bP01029 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4bP01029 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4bP01029 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4bP01029 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4bP01029 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4bP01029 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4bP01029 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4bP01029 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4bP01029 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4bP01029 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4bP01029 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4bP01029 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4bP01029 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C4bP01029 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4bP01029 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4bP01029 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4bP01029 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4bP01029 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4bP01029 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C4bP01029 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C4bP01029 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C4bP01029 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C4bP01029 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C4bP01029 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C4bP01029 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C4bP01029 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C4bP01029 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C4bP01029 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C4bP01029 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C4bP01029 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C4bP01029 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4bP01029 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4bP01029 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4bP01029 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4bP01029 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4bP01029 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4bP01029 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4bP01029 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4bP01029 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4bP01029 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4bP01029 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4bP01029 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4bP01029 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4bP01029 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4bP01029 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4bP01029 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4bP01029 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C4bP01029 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C4bP01029 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C4bP01029 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C4bP01029 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C4bP01029 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4bP01029 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4bP01029 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4bP01029 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4bP01029 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4bP01029 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C4bP01029 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms