Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vti1bO88384 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vti1bO88384 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms