Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srpk1O70551 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms