Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb5O70309 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb5O70309 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms