Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1bO70237 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms