Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AurkbO70126 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AurkbO70126 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AurkbO70126 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AurkbO70126 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AurkbO70126 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
AurkbO70126 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AurkbO70126 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AurkbO70126 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AurkbO70126 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AurkbO70126 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms