Protein–RNA interactions for Protein: O55242

Sigmar1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, mousemouse

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sigmar1O55242 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms