Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cbx4O55187 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms