Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms