Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NlkO54949 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NlkO54949 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NlkO54949 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NlkO54949 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NlkO54949 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NlkO54949 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NlkO54949 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NlkO54949 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NlkO54949 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NlkO54949 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NlkO54949 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NlkO54949 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NlkO54949 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NlkO54949 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NlkO54949 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NlkO54949 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NlkO54949 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NlkO54949 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NlkO54949 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NlkO54949 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NlkO54949 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NlkO54949 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NlkO54949 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NlkO54949 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NlkO54949 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NlkO54949 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NlkO54949 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NlkO54949 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NlkO54949 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NlkO54949 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NlkO54949 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NlkO54949 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NlkO54949 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NlkO54949 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NlkO54949 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NlkO54949 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NlkO54949 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NlkO54949 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NlkO54949 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NlkO54949 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NlkO54949 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NlkO54949 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NlkO54949 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NlkO54949 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NlkO54949 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NlkO54949 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NlkO54949 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NlkO54949 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NlkO54949 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NlkO54949 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NlkO54949 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NlkO54949 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NlkO54949 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NlkO54949 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NlkO54949 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NlkO54949 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NlkO54949 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NlkO54949 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NlkO54949 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NlkO54949 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NlkO54949 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NlkO54949 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NlkO54949 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NlkO54949 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NlkO54949 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NlkO54949 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NlkO54949 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NlkO54949 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NlkO54949 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NlkO54949 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NlkO54949 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NlkO54949 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NlkO54949 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NlkO54949 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NlkO54949 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NlkO54949 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NlkO54949 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NlkO54949 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NlkO54949 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NlkO54949 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NlkO54949 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NlkO54949 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NlkO54949 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NlkO54949 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NlkO54949 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NlkO54949 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NlkO54949 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NlkO54949 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NlkO54949 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NlkO54949 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NlkO54949 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NlkO54949 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NlkO54949 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NlkO54949 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NlkO54949 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NlkO54949 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NlkO54949 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NlkO54949 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NlkO54949 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms