Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Dnajb6O54946 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms