Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rdh16O54909 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms