Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Atp10aO54827 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atp10aO54827 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms