Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cavin1O54724 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms