Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EdaO54693 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EdaO54693 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EdaO54693 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EdaO54693 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EdaO54693 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EdaO54693 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EdaO54693 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EdaO54693 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EdaO54693 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EdaO54693 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EdaO54693 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EdaO54693 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EdaO54693 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EdaO54693 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EdaO54693 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EdaO54693 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
EdaO54693 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EdaO54693 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EdaO54693 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
EdaO54693 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EdaO54693 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EdaO54693 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
EdaO54693 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EdaO54693 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EdaO54693 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EdaO54693 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EdaO54693 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EdaO54693 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EdaO54693 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EdaO54693 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EdaO54693 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EdaO54693 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EdaO54693 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EdaO54693 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EdaO54693 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EdaO54693 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EdaO54693 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EdaO54693 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EdaO54693 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EdaO54693 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EdaO54693 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EdaO54693 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EdaO54693 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EdaO54693 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EdaO54693 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EdaO54693 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EdaO54693 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EdaO54693 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EdaO54693 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EdaO54693 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EdaO54693 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EdaO54693 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EdaO54693 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EdaO54693 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EdaO54693 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EdaO54693 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EdaO54693 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EdaO54693 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EdaO54693 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EdaO54693 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EdaO54693 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EdaO54693 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EdaO54693 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EdaO54693 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EdaO54693 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EdaO54693 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EdaO54693 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EdaO54693 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EdaO54693 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EdaO54693 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EdaO54693 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EdaO54693 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EdaO54693 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EdaO54693 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EdaO54693 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EdaO54693 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EdaO54693 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EdaO54693 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EdaO54693 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EdaO54693 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EdaO54693 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EdaO54693 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EdaO54693 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EdaO54693 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EdaO54693 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EdaO54693 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EdaO54693 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EdaO54693 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EdaO54693 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EdaO54693 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EdaO54693 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EdaO54693 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EdaO54693 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EdaO54693 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EdaO54693 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EdaO54693 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EdaO54693 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EdaO54693 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EdaO54693 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms