Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FxnO35943 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FxnO35943 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FxnO35943 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FxnO35943 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FxnO35943 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FxnO35943 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FxnO35943 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FxnO35943 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FxnO35943 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FxnO35943 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FxnO35943 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FxnO35943 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FxnO35943 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FxnO35943 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FxnO35943 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FxnO35943 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FxnO35943 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FxnO35943 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FxnO35943 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FxnO35943 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FxnO35943 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FxnO35943 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FxnO35943 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FxnO35943 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FxnO35943 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FxnO35943 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FxnO35943 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FxnO35943 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FxnO35943 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FxnO35943 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FxnO35943 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FxnO35943 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FxnO35943 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FxnO35943 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FxnO35943 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FxnO35943 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FxnO35943 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FxnO35943 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FxnO35943 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FxnO35943 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FxnO35943 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FxnO35943 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FxnO35943 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FxnO35943 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FxnO35943 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FxnO35943 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FxnO35943 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FxnO35943 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FxnO35943 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FxnO35943 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FxnO35943 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FxnO35943 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FxnO35943 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FxnO35943 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FxnO35943 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FxnO35943 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FxnO35943 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FxnO35943 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FxnO35943 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FxnO35943 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FxnO35943 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FxnO35943 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FxnO35943 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FxnO35943 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FxnO35943 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FxnO35943 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FxnO35943 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FxnO35943 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FxnO35943 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FxnO35943 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FxnO35943 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FxnO35943 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FxnO35943 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FxnO35943 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FxnO35943 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FxnO35943 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FxnO35943 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FxnO35943 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FxnO35943 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FxnO35943 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FxnO35943 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FxnO35943 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FxnO35943 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FxnO35943 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FxnO35943 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FxnO35943 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FxnO35943 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FxnO35943 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FxnO35943 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FxnO35943 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FxnO35943 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FxnO35943 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FxnO35943 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FxnO35943 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FxnO35943 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FxnO35943 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FxnO35943 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FxnO35943 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FxnO35943 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms