Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cops5O35864 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cops5O35864 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cops5O35864 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cops5O35864 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cops5O35864 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cops5O35864 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cops5O35864 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cops5O35864 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cops5O35864 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cops5O35864 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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