Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppfibp2O35711 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppfibp2O35711 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms