Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NudcO35685 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NudcO35685 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NudcO35685 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NudcO35685 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NudcO35685 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NudcO35685 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NudcO35685 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NudcO35685 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NudcO35685 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NudcO35685 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NudcO35685 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NudcO35685 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NudcO35685 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NudcO35685 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NudcO35685 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NudcO35685 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NudcO35685 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NudcO35685 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NudcO35685 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NudcO35685 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NudcO35685 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NudcO35685 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NudcO35685 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NudcO35685 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NudcO35685 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NudcO35685 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NudcO35685 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NudcO35685 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NudcO35685 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NudcO35685 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NudcO35685 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NudcO35685 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NudcO35685 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NudcO35685 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NudcO35685 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NudcO35685 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NudcO35685 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NudcO35685 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NudcO35685 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NudcO35685 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NudcO35685 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NudcO35685 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NudcO35685 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NudcO35685 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
NudcO35685 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NudcO35685 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NudcO35685 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NudcO35685 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NudcO35685 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NudcO35685 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NudcO35685 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NudcO35685 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NudcO35685 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NudcO35685 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NudcO35685 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NudcO35685 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NudcO35685 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NudcO35685 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NudcO35685 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NudcO35685 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NudcO35685 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NudcO35685 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NudcO35685 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NudcO35685 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NudcO35685 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NudcO35685 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NudcO35685 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NudcO35685 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NudcO35685 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NudcO35685 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NudcO35685 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NudcO35685 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NudcO35685 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NudcO35685 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NudcO35685 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NudcO35685 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NudcO35685 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NudcO35685 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NudcO35685 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NudcO35685 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NudcO35685 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NudcO35685 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NudcO35685 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NudcO35685 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NudcO35685 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NudcO35685 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NudcO35685 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NudcO35685 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NudcO35685 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NudcO35685 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NudcO35685 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NudcO35685 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NudcO35685 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NudcO35685 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NudcO35685 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NudcO35685 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NudcO35685 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NudcO35685 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NudcO35685 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms