Protein–RNA interactions for Protein: O35516

Notch2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch2O35516 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Notch2O35516 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Notch2O35516 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch2O35516 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch2O35516 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch2O35516 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Notch2O35516 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Notch2O35516 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Notch2O35516 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Notch2O35516 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Notch2O35516 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Notch2O35516 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Notch2O35516 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Notch2O35516 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms