Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Atf6bO35451 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Atf6bO35451 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atf6bO35451 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atf6bO35451 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atf6bO35451 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atf6bO35451 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atf6bO35451 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atf6bO35451 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atf6bO35451 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atf6bO35451 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atf6bO35451 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atf6bO35451 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atf6bO35451 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atf6bO35451 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atf6bO35451 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atf6bO35451 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atf6bO35451 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atf6bO35451 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf6bO35451 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf6bO35451 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf6bO35451 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf6bO35451 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf6bO35451 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf6bO35451 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf6bO35451 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf6bO35451 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf6bO35451 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf6bO35451 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atf6bO35451 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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