Protein–RNA interactions for Protein: O35393

Efnb3, Ephrin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb3O35393 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms