Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dgcr6O35347 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dgcr6O35347 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dgcr6O35347 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dgcr6O35347 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dgcr6O35347 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dgcr6O35347 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dgcr6O35347 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dgcr6O35347 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dgcr6O35347 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dgcr6O35347 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dgcr6O35347 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dgcr6O35347 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dgcr6O35347 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dgcr6O35347 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dgcr6O35347 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dgcr6O35347 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dgcr6O35347 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dgcr6O35347 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dgcr6O35347 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dgcr6O35347 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dgcr6O35347 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dgcr6O35347 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Dgcr6O35347 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Dgcr6O35347 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Dgcr6O35347 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Dgcr6O35347 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Dgcr6O35347 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Dgcr6O35347 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Dgcr6O35347 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Dgcr6O35347 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Dgcr6O35347 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Dgcr6O35347 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Dgcr6O35347 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Dgcr6O35347 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Dgcr6O35347 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Dgcr6O35347 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dgcr6O35347 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dgcr6O35347 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dgcr6O35347 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
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Dgcr6O35347 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dgcr6O35347 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dgcr6O35347 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dgcr6O35347 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dgcr6O35347 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Dgcr6O35347 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms