Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh2d1bO35324 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms