Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NmiO35309 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NmiO35309 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NmiO35309 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NmiO35309 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NmiO35309 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NmiO35309 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NmiO35309 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NmiO35309 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NmiO35309 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NmiO35309 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NmiO35309 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NmiO35309 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NmiO35309 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NmiO35309 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NmiO35309 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NmiO35309 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NmiO35309 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NmiO35309 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NmiO35309 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NmiO35309 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NmiO35309 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NmiO35309 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NmiO35309 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NmiO35309 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NmiO35309 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NmiO35309 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NmiO35309 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NmiO35309 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NmiO35309 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NmiO35309 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NmiO35309 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NmiO35309 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NmiO35309 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NmiO35309 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NmiO35309 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NmiO35309 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NmiO35309 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NmiO35309 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NmiO35309 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NmiO35309 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NmiO35309 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NmiO35309 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NmiO35309 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NmiO35309 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NmiO35309 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NmiO35309 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NmiO35309 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NmiO35309 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NmiO35309 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NmiO35309 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NmiO35309 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NmiO35309 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NmiO35309 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NmiO35309 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NmiO35309 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NmiO35309 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NmiO35309 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NmiO35309 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NmiO35309 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NmiO35309 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NmiO35309 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NmiO35309 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NmiO35309 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NmiO35309 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NmiO35309 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NmiO35309 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NmiO35309 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NmiO35309 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NmiO35309 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NmiO35309 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NmiO35309 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NmiO35309 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NmiO35309 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NmiO35309 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NmiO35309 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NmiO35309 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NmiO35309 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NmiO35309 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NmiO35309 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NmiO35309 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NmiO35309 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NmiO35309 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NmiO35309 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NmiO35309 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NmiO35309 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NmiO35309 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NmiO35309 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NmiO35309 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NmiO35309 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NmiO35309 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NmiO35309 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NmiO35309 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NmiO35309 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NmiO35309 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NmiO35309 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NmiO35309 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NmiO35309 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NmiO35309 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NmiO35309 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms