Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ebi3O35228 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ebi3O35228 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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