Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe40O35185 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms