Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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