Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Q1O19441 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Q1O19441 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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H2-Q1O19441 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Q1O19441 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Q1O19441 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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H2-Q1O19441 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Q1O19441 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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H2-Q1O19441 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-Q1O19441 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-Q1O19441 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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H2-Q1O19441 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-Q1O19441 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-Q1O19441 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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H2-Q1O19441 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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H2-Q1O19441 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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H2-Q1O19441 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-Q1O19441 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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H2-Q1O19441 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-Q1O19441 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
H2-Q1O19441 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-Q1O19441 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-Q1O19441 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-Q1O19441 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-Q1O19441 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-Q1O19441 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-Q1O19441 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-Q1O19441 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-Q1O19441 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-Q1O19441 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-Q1O19441 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-Q1O19441 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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