Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casq1O09165 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casq1O09165 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casq1O09165 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casq1O09165 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casq1O09165 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casq1O09165 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casq1O09165 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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