Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CckarO08786 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CckarO08786 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CckarO08786 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CckarO08786 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CckarO08786 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CckarO08786 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CckarO08786 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CckarO08786 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckarO08786 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckarO08786 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckarO08786 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckarO08786 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckarO08786 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckarO08786 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckarO08786 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckarO08786 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckarO08786 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckarO08786 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckarO08786 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckarO08786 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckarO08786 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckarO08786 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckarO08786 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckarO08786 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckarO08786 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckarO08786 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckarO08786 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CckarO08786 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckarO08786 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckarO08786 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckarO08786 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckarO08786 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckarO08786 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckarO08786 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckarO08786 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckarO08786 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckarO08786 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckarO08786 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckarO08786 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CckarO08786 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CckarO08786 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CckarO08786 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CckarO08786 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CckarO08786 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CckarO08786 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CckarO08786 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CckarO08786 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CckarO08786 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CckarO08786 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CckarO08786 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CckarO08786 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CckarO08786 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CckarO08786 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CckarO08786 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CckarO08786 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CckarO08786 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CckarO08786 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CckarO08786 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CckarO08786 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CckarO08786 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CckarO08786 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CckarO08786 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CckarO08786 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CckarO08786 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CckarO08786 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CckarO08786 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CckarO08786 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CckarO08786 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CckarO08786 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CckarO08786 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CckarO08786 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CckarO08786 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CckarO08786 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CckarO08786 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CckarO08786 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CckarO08786 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CckarO08786 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CckarO08786 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CckarO08786 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CckarO08786 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CckarO08786 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CckarO08786 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CckarO08786 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CckarO08786 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CckarO08786 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CckarO08786 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CckarO08786 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CckarO08786 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CckarO08786 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CckarO08786 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CckarO08786 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CckarO08786 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CckarO08786 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CckarO08786 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CckarO08786 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CckarO08786 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CckarO08786 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CckarO08786 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CckarO08786 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms