Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcof1O08784 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcof1O08784 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcof1O08784 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcof1O08784 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcof1O08784 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcof1O08784 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcof1O08784 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcof1O08784 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcof1O08784 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcof1O08784 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcof1O08784 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcof1O08784 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcof1O08784 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcof1O08784 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcof1O08784 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcof1O08784 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcof1O08784 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tcof1O08784 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tcof1O08784 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tcof1O08784 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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