Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MsmbO08540 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MsmbO08540 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MsmbO08540 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MsmbO08540 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MsmbO08540 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
MsmbO08540 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MsmbO08540 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MsmbO08540 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MsmbO08540 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MsmbO08540 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MsmbO08540 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MsmbO08540 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MsmbO08540 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MsmbO08540 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MsmbO08540 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MsmbO08540 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MsmbO08540 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MsmbO08540 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MsmbO08540 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MsmbO08540 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MsmbO08540 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MsmbO08540 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MsmbO08540 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MsmbO08540 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MsmbO08540 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MsmbO08540 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MsmbO08540 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MsmbO08540 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MsmbO08540 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MsmbO08540 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MsmbO08540 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MsmbO08540 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
MsmbO08540 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MsmbO08540 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MsmbO08540 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MsmbO08540 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MsmbO08540 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MsmbO08540 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MsmbO08540 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsmbO08540 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsmbO08540 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MsmbO08540 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MsmbO08540 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsmbO08540 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MsmbO08540 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsmbO08540 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsmbO08540 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsmbO08540 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsmbO08540 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MsmbO08540 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsmbO08540 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsmbO08540 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MsmbO08540 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MsmbO08540 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MsmbO08540 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MsmbO08540 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
MsmbO08540 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MsmbO08540 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MsmbO08540 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MsmbO08540 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
MsmbO08540 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MsmbO08540 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MsmbO08540 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MsmbO08540 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MsmbO08540 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms