Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms