Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 347.9 ms