Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn2r88L7N1W8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn2r88L7N1W8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn2r88L7N1W8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn2r88L7N1W8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn2r88L7N1W8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn2r88L7N1W8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn2r88L7N1W8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn2r88L7N1W8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn2r88L7N1W8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn2r88L7N1W8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn2r88L7N1W8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn2r88L7N1W8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn2r88L7N1W8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn2r88L7N1W8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn2r88L7N1W8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn2r88L7N1W8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn2r88L7N1W8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn2r88L7N1W8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn2r88L7N1W8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn2r88L7N1W8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn2r88L7N1W8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn2r88L7N1W8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn2r88L7N1W8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn2r88L7N1W8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn2r88L7N1W8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn2r88L7N1W8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn2r88L7N1W8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn2r88L7N1W8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn2r88L7N1W8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn2r88L7N1W8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn2r88L7N1W8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn2r88L7N1W8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn2r88L7N1W8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn2r88L7N1W8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn2r88L7N1W8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn2r88L7N1W8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn2r88L7N1W8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn2r88L7N1W8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vmn2r88L7N1W8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vmn2r88L7N1W8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms