Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21310J3QQ23 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21310J3QQ23 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21310J3QQ23 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21310J3QQ23 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21310J3QQ23 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21310J3QQ23 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21310J3QQ23 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21310J3QQ23 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21310J3QQ23 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21310J3QQ23 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21310J3QQ23 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21310J3QQ23 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21310J3QQ23 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21310J3QQ23 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21310J3QQ23 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21310J3QQ23 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21310J3QQ23 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21310J3QQ23 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21310J3QQ23 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21310J3QQ23 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21310J3QQ23 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21310J3QQ23 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21310J3QQ23 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21310J3QQ23 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21310J3QQ23 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21310J3QQ23 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21310J3QQ23 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21310J3QQ23 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21310J3QQ23 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21310J3QQ23 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm21310J3QQ23 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21310J3QQ23 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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