Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2056J3QQ02 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms