Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm17577J3QNF7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm17577J3QNF7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm17577J3QNF7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm17577J3QNF7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm17577J3QNF7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm17577J3QNF7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm17577J3QNF7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm17577J3QNF7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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