Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Ccdc180J3QNE4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Ccdc180J3QNE4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ccdc180J3QNE4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ccdc180J3QNE4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ccdc180J3QNE4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Ccdc180J3QNE4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ccdc180J3QNE4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ccdc180J3QNE4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ccdc180J3QNE4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccdc180J3QNE4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccdc180J3QNE4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccdc180J3QNE4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccdc180J3QNE4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccdc180J3QNE4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccdc180J3QNE4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccdc180J3QNE4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Ccdc180J3QNE4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ccdc180J3QNE4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms