Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930544D05RikJ3QK56 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
4930544D05RikJ3QK56 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms