Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp17lcG5E8I7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp17lcG5E8I7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp17lcG5E8I7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp17lcG5E8I7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp17lcG5E8I7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17lcG5E8I7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
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