Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r58G3X9U3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms