Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
2610008E11RikG3X964 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms