Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zkscan2G3X952 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zkscan2G3X952 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zkscan2G3X952 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Zkscan2G3X952 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zkscan2G3X952 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zkscan2G3X952 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zkscan2G3X952 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zkscan2G3X952 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zkscan2G3X952 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zkscan2G3X952 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zkscan2G3X952 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zkscan2G3X952 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Zkscan2G3X952 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zkscan2G3X952 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zkscan2G3X952 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zkscan2G3X952 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Zkscan2G3X952 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zkscan2G3X952 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zkscan2G3X952 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zkscan2G3X952 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zkscan2G3X952 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Zkscan2G3X952 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zkscan2G3X952 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zkscan2G3X952 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zkscan2G3X952 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms