Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SprtnG3X912 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms