Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms