Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 380.7 ms