Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Srp72F8VQC1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms