Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NpcdF8VQB8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NpcdF8VQB8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NpcdF8VQB8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms